Relations entre les modifications des histones, l’organisation tridimensionnelle du génome et la régulation de l’expression génique

L’expression temporelle et spatiale des génomes est influencée par la topologie de la chromatine, qui est régie par des processus conservés. Ces mécanismes sont impliqués dans de nombreuses adaptations, notamment la réponse aux stress biotiques et abiotiques ainsi que dans les programmes de développement. Mais de nombreuses questions restent encore sans réponse, que nous nous efforçons actuellement d’élucider :

• Quels sont les facteurs qui déterminent l’architecture de la chromatine ?
• Comment les contacts promoteur-activateur s’établissent-ils chez les plantes ?
• Comment ces contacts s’établissent-ils et se rompent-ils en fonction de signaux régulateurs spatio-temporels ?
•  Quels sont les rôles des facteurs de transcription (FT) dans la formation et/ou la stabilité des contacts promoteur-activateur ?
• Quels sont les mécanismes moléculaires qui sous-tendent ce phénomène ?

Dans ce contexte, pour répondre à ces questions, nous utilisons des approches génétiques, génomiques et épigénomiques.