FunRNA

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Équipe FunRNA / Thomas Blein & Jérémie Bazin

Présentation

L’équipe FunRNA vise à décrypter les fonctions des longs ARN non codants chez les plantes et à comprendre leur contribution aux mécanismes d’adaptation. L’équipe combine approches computationnelles et analyses expérimentales pour développer des modèles prédictifs capables d’inférer leur fonction à partir de leurs caractéristiques moléculaires et évolutives. En étudiant leur implication dans la réponse au stress thermique et la conservation de leurs fonctions au cours de l’évolution, FunRNA cherche à identifier les principes généraux qui sous-tendent l’acclimatation et la résilience des plantes face aux fluctuations de température. À terme, nous espérons découvrir de nouveaux leviers pour limiter l’impact du changement climatique sur les végétaux.

En savoir plus
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Membres permanents
Membres non permanents
Anciens membres

Publications

2026
Gaggion N, Boccardo NA, Bonazzola R, Legascue MF, Mammarella MF, Rodriguez FS, Aballay FE, Catulo FB, Barrios A, Santoro LJ, Accavallo F, Villarreal SN, Pereyra-Bistrain LI, Benhamed M, Crespi M, Ricardi MM, Petrillo E, Blein T, Ariel F, Ferrante E (2026). ChronoRoot 2.0: An Open AI-Powered Platform for 2D Temporal Plant Phenotyping. Gigascience., giag018. doi: 10.1093/gigascience/giag018
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2025
Traubenik S, Reynoso MA, Sánchez-Rodríguez F, Yacullo M, Christ A, Hummel M, Blein T, Crespi M, Bailey-Serres J, Blanco FA, Zanetti ME (2025). Subunit 3 of the SUPERKILLER complex mediates microRNA172-directed cleavage of Nodule Number Control 1 in Medicago truncatula. Plant Physiol., 199(2):kiaf425. doi: 10.1093/plphys/kiaf425
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2025
Montessoro P, Paixão JFR, Costa CNM, Ducatti L, Grangeiro LP, Ruivo V, Fusaro AF, Ballesteros HF, Iurif V, Cabral LM, de Andrade JC, Tessaro L, Bernado WP, Coelho FS, de Araújo-Lopes BG, de Almeida Engler J, Bazin J, Campostrini E, Conte-Junior CA, Hemerly AS (2025). The ABAP1 interacting protein 10 (AIP10) exerts a dual role in the cell cycle and primary metabolism pathways in Arabidopsis thaliana. Plant J. ;123(3):e70399. doi: 10.1111/tpj.70399. Erratum in: Plant J. 2025 124(2):e70508. doi: 10.1111/tpj.70508.
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2025
Mammi P, Blein T (2025). From non-coding to chromatin regulators: VIVIpary and the rise of lncRNAs in plant biology. Mol Plant., 18(8):1259-1261. doi: 10.1016/j.molp.2025.06.011
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2025
Elmayan T, Blein T, Elvira-Matelot E, Le Masson I, Christ A, Bouteiller N, Crespi MD, Vaucheret H (2025). Arabidopsis SGS3 is recruited to chromatin by CHR11 to select RNA that initiate siRNA production. Nat Commun., 16(1):2978. doi: 10.1038/s41467-025-57394-5
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2023
Bazin J, Elvira-Matelot E, Blein T, Jauvion V, Bouteiller N, Cao J, Crespi MD, Vaucheret H (2023). Synergistic action of the Arabidopsis spliceosome components PRP39a and SmD1b in promoting posttranscriptional transgene silencing. Plant Cell., 35(6):1917-1935. doi: 10.1093/plcell/koad091
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Collaborations

Projets en cours

 Projet ANR : Imogen « Inter-organ modulation of gene regulatory networks in plants: the example of the CUP-SHAPED COTYLEDON genes » (2025-2028). Partenaire : Patrick Laufs (IJPB, Versailles).

 Projet ANR : EvoRNAs « An Evo-Devo approach to the role of RNA-RBP binding on Alternative Splicing » (2025-2028). Partenaires : Pierre-Marc Delaux (LRSV, Toulouse) et Daniel Gautheret (I2BC, Gif-sur-Yvette).

Projet ANR :RESOLAT « Non-coding RNAs regulatory networks controlling lateral root organogenesis across Brassicaceae » (2025-2028). Partenaires : Mikaël Lucas (DIADE, Montpellier).

Projet ANR-NRF : DHARP « Drought and Heat Tolerance in Plants through AI-Assisted Long Noncoding RNAs Design » (2025-2028). Partenaires : Daniel Gautheret (I2BC, Gif-sur-Yvette), Choonkyun Jung (SNU, Corée) et Hye Sun Cho (KRIBB, Corée)

Projet ECOS-Sud Chili (2025-2027): « lncRNAs control gene regulatory networks under dual phosphate starvation and salt stress in Arabidopsis roots ». Partenaire : José M. Estevez (UNAB, Chili)

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