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  • Edition 2026 du barbecue de l’IPS2

    Edition 2026 du barbecue de l’IPS2

    Un barbecue estival placé sous le signe de la convivialité

    Le traditionnel barbecue de l’IPS2 s’est déroulé dans une ambiance chaleureuse et conviviale, et cette année aussi avec de chaudes températures, réunissant les membres de l’institut autour d’un moment de partage avant la période de vacances estivales.

    La fête s’est poursuivie en musique grâce au concert du groupe de l’IPS2, qui a offert une belle prestation très appréciée du public. Les festivités se sont ensuite terminées par la célébration de l’anniversaire de notre précédent Directeur d’Unité Martin Crespi, dans l’émotion et la bonne humeur.

    Un grand merci à toutes les personnes qui ont participé à l’organisation de cet événement et à tous ceux qui étaient présents pour faire de cette soirée un beau moment de convivialité.

    barbecue
  • WIP et auxine contrôlent le développement de la mousse Physcomitrium patens

    WIP et auxine contrôlent le développement de la mousse Physcomitrium patens

    Des facteurs de transcription WIP anciens régulent le développement de la mousse Physcomitrium patens de manière dépendante de l’auxine

    Dans une étude publiée dans PNAS, les scientifiques de l’équipe FLOCAD, en collaboration avec  l’équipe DRAGON (IJPB), ont démontré qu’une famille ancestrale de facteurs de transcription, les protéines WIP, contrôle des étapes clés du développement chez la mousse Physcomitrium patens, un organisme modèle utilisé pour comprendre l’évolution des plantes terrestres.

    Les chercheurs ont démontré que ces protéines agissent au cours des deux grandes phases du cycle de vie des mousses en régulant la production d’auxine, une hormone essentielle au développement végétal. Elles favorisent notamment la croissance des tissus végétatifs tout en limitant la formation de plusieurs sporophytes sur une même plante, un phénomène rare appelé polysétie.

    En comparant ces mécanismes avec ceux observés chez Arabidopsis thaliana, les auteurs montrent que la fonction moléculaire des protéines WIP est largement conservée, et ce depuis les premiers végétaux terrestres, tout en ayant été adaptée au cours de l’évolution pour générer de nouvelles structures chez les plantes à fleurs. Ces résultats apportent un nouvel éclairage sur les mécanismes génétiques qui ont accompagné la diversification des plantes terrestres au cours de plus de 450 millions d’années d’évolution

    wip
    Vue d’ensemble des gamétophores du type sauvage et du mutant wip1wip2.
  • Réorganisation 3D du génome et nodulation symbiotique

    Réorganisation 3D du génome et nodulation symbiotique

    La réorganisation tridimensionnelle du génome permet l’activation de la nodulation symbiotique par les cytokinines

    Les légumineuses établissent des interactions symbiotiques avec des bactéries du sol collectivement appelées rhizobia, conduisant à la formation de nodosités racinaires fixatrices d’azote. Ce processus nécessite une importante reprogrammation transcriptionnelle, associée à des changements dynamiques de la méthylation de l’ADN et à des modifications d’histones. Cependant, comment l’architecture tridimensionnelle (3D) du génome régule la symbiose rhizobienne reste largement méconnu. Dans une nouvelle étude collaborative publiée dans Plant Communications par les équipes de Florian Frugier (SILEG) et Moussa Benhamed (ChromD) à l’IPS2, nous révélons grâce à la technique de capture de conformation des chromosomes à haut débit (Hi-C), que l’organisation 3D de la chromatine subit des remaniements majeurs dans les nodosités symbiotiques fixatrices d’azote comparé aux racines non-symbiotiques et aux nodosités non-fixatrices d’azote. Ces changements impliquent des modifications de la compartimentation A / B et la formation de boucles « enhancer »-promoteur liées au processus symbiotique. De façon remarquable, nous avons identifié une boucle de chromatine de 15 kb reliant un élément « enhancer » distal au promoteur proximal du gène NODULE INCEPTION (NIN), un régulateur clé de la nodulation. Cette région « enhancer » contient plusieurs éléments de réponse aux cytokinines (CK), et nous avons montré que l’induction de NIN par les CK dans les racines est associée à cette interaction «enhancer»-promoteur. De plus, nous avons pu démontrer que le facteur de transcription RESPONSE REGULATOR B 3 (RRB3), appartenant à la voie de signalisation des CK, se lie spécifiquement à cette région distale et participe à la formation de la boucle « enhancer»-promoteur. Ces résultats mettent en évidence le rôle fondamental de l’organisation 3D de la chromatine dans la régulation de l’expression génique lors de la symbiose légumineuse-rhizobium, révélant un mécanisme de régulation via lequel la signalisation hormonale façonne l’architecture du génome et module l’activation du gène NIN.

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    La région « enhancer » distale située en amont du gène NODULE INCEPTION (NIN) devient accessible en réponse aux cytokinines
    Profils ATAC-Seq dans des racines non-traitées et dans des racines traitées aux cytokinines pendant 1 heure. La position de la boucle chromatinienne associée aux éléments cis de réponse aux cytokinines (« Cytokinin Element (CE) chromatin loop ») est indiquée en haut.