


Équipe GEDY / Valérie Geffroy
Présentation
Dynamique du génome et résistance aux agents pathogènes
La préservation de la stabilité et de l’intégrité du génome est la tâche principale de chaque organisme, y compris les plantes. En même temps, le génome des plantes doit s’adapter à des environnements changeants, y compris les stress liés aux agents pathogènes. Les stress biotiques causés par les virus, les champignons, les bactéries, les insectes et autres agents pathogènes constituent une contrainte majeure à la productivité agricole. L’utilisation de génotypes résistants (R) est le moyen le plus économique et le plus écologique de lutter contre les maladies des plantes. Par conséquent, les gènes R sont une composante cruciale de l’agriculture durable. Au niveau moléculaire, la plupart des gènes R clonés codent des protéines intracellulaires de type NB-LRR (NLR) (nucleotide binding-leucine rich-repeat). Les gènes R appartenant à cette classe ont été identifiés chez toutes les espèces végétales et sont efficaces contre tous types d’agents pathogènes. Nos recherches visent à mieux comprendre les bases moléculaires de la résistance chez les légumineuses à l’aide d’outils de génétiques, génomiques et phytopathologiques. Nous travaillons principalement avec le haricot commun (Phaseolus vulgaris), la légumineuse à graines la plus consommée en alimentation humaine dans le monde, en particulier dans les pays en développement où il constitue la principale source de protéines.
Notre objectif est de mieux comprendre l’évolution des gènes de résistance aux maladies chez les plantes, en mettant l’accent sur le génome du haricot commun. Trois principaux domaines de recherche sont développés :
- Analyse à l’échelle du génome des gènes NLR dans le génome du haricot commun.
- Développement et mise en œuvre d’outils de validation fonctionnelle chez le haricot commun (VIGS, transformation transitoire et stable, édition).
- Résistance des plantes dans le contexte du changement climatique et de l’agriculture biologique.
Pour atteindre nos objectifs, nous combinons des approches de génomiques structurales et comparatives, de séquençage à haut débit (ADN, petit ARN, méthylome), des analyses génétiques classiques et des tests de pathogénicité avec 3 agents pathogènes [le champignon Colletotrichum lindemuthianum -agent d’anthracnose -, le virus BPMV (Bean pod mottle virus) et le virus BCMNV (Bean common mosaic virus)].
Nous espérons que nos travaux produiront des connaissances à la fois académiques et appliquées et contribueront à promouvoir une agriculture durable dans le contexte du changement climatique.


Ariane Gratias – Weill
Maitre de Conférences, Université Paris-Saclay


Maria-Victoria Prejean
Technicienne de recherche, INRAE


Michel Dron
Professeur-Emérite des Universités, Université Paris-Saclay

Stéphanie Pflieger
Maitre de Conférences, Université de Paris Cité

Valérie Geffroy
Directrice de Recherche, INRAE, Responsable d’équipe
